MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 7261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017857	CTTA	2	8	2652701	2652708	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6002	NC_017857	CGA	2	6	2654205	2654210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_017857	T	7	7	2654221	2654227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_017857	ATT	2	6	2654239	2654244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_017857	A	6	6	2654255	2654260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_017857	GAT	2	6	2654273	2654278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_017857	AAT	3	9	2654287	2654295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_017857	GC	3	6	2654306	2654311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_017857	CT	3	6	2655264	2655269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6010	NC_017857	ACC	2	6	2659219	2659224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_017857	TAA	2	6	2663633	2663638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_017857	ATTT	2	8	2663879	2663886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_017857	CAT	2	6	2663910	2663915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_017857	CAT	2	6	2665266	2665271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_017857	AGT	2	6	2665295	2665300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_017857	TCAT	2	8	2665356	2665363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6017	NC_017857	T	6	6	2665386	2665391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_017857	A	6	6	2665519	2665524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_017857	AAAT	2	8	2665529	2665536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_017857	TGC	2	6	2665541	2665546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_017857	GTCC	2	8	2668278	2668285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_017857	AGCA	2	8	2671063	2671070	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6023	NC_017857	ATT	2	6	2671106	2671111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_017857	AGGT	2	8	2671119	2671126	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_017857	TGT	2	6	2671136	2671141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_017857	CAC	2	6	2671156	2671161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_017857	TTGA	2	8	2671184	2671191	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_017857	CTG	2	6	2672670	2672675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_017857	TCA	2	6	2672715	2672720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_017857	A	6	6	2674886	2674891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_017857	ATAAA	2	10	2674894	2674903	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_017857	CAAA	2	8	2674960	2674967	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6033	NC_017857	A	7	7	2674965	2674971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_017857	TTG	2	6	2675484	2675489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_017857	AGCT	2	8	2676020	2676027	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6036	NC_017857	TAC	2	6	2676054	2676059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_017857	TAA	2	6	2676068	2676073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_017857	A	8	8	2676086	2676093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_017857	CAT	3	9	2676094	2676102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_017857	T	6	6	2676146	2676151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_017857	ATT	2	6	2676201	2676206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_017857	CAGA	2	8	2678057	2678064	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6043	NC_017857	ATT	2	6	2683398	2683403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_017857	TCA	2	6	2683473	2683478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_017857	TA	3	6	2683528	2683533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_017857	TCA	2	6	2685013	2685018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_017857	CAG	2	6	2685030	2685035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_017857	GTC	2	6	2685093	2685098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_017857	GAC	2	6	2685133	2685138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_017857	ATAA	2	8	2685172	2685179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_017857	AAAG	2	8	2685183	2685190	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_017857	CCTC	2	8	2685983	2685990	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6053	NC_017857	GGAG	2	8	2686002	2686009	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_017857	CCT	2	6	2686479	2686484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_017857	AAT	2	6	2686485	2686490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_017857	TAA	2	6	2686701	2686706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_017857	GAA	2	6	2686764	2686769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_017857	A	6	6	2686800	2686805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_017857	TA	3	6	2686837	2686842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_017857	TGT	2	6	2687841	2687846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_017857	CAA	2	6	2687850	2687855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_017857	GTA	2	6	2687877	2687882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_017857	CAC	2	6	2688703	2688708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_017857	AATA	2	8	2688750	2688757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_017857	TAA	2	6	2689138	2689143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_017857	CGAT	2	8	2689258	2689265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6067	NC_017857	A	8	8	2689315	2689322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_017857	ATT	2	6	2689350	2689355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_017857	T	7	7	2689450	2689456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_017857	AGT	2	6	2689483	2689488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_017857	TCGTT	2	10	2690194	2690203	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6072	NC_017857	ATA	2	6	2696699	2696704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_017857	ATCA	2	8	2703011	2703018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6074	NC_017857	CAT	2	6	2703030	2703035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_017857	ATC	2	6	2703077	2703082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_017857	CTG	2	6	2703094	2703099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_017857	AATC	2	8	2703116	2703123	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6078	NC_017857	ATT	2	6	2703126	2703131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_017857	GA	3	6	2703141	2703146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_017857	TGA	2	6	2703680	2703685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_017857	T	6	6	2703708	2703713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_017857	GA	3	6	2704494	2704499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_017857	A	6	6	2705925	2705930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_017857	CAT	2	6	2705995	2706000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_017857	ATC	2	6	2708697	2708702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_017857	TTA	2	6	2708786	2708791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_017857	CTATA	2	10	2708794	2708803	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6088	NC_017857	TTCA	2	8	2708839	2708846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6089	NC_017857	TTA	2	6	2708873	2708878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_017857	ATT	2	6	2716019	2716024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_017857	AACCG	2	10	2716578	2716587	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6092	NC_017857	ATT	2	6	2716656	2716661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_017857	AGC	2	6	2723019	2723024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_017857	TCC	2	6	2724397	2724402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6095	NC_017857	ATT	2	6	2724457	2724462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_017857	GAAA	2	8	2724468	2724475	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_017857	GGT	2	6	2724719	2724724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_017857	AGT	2	6	2724735	2724740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_017857	GGC	2	6	2724753	2724758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_017857	ACA	2	6	2724891	2724896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_017857	CGA	2	6	2724921	2724926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_017857	A	6	6	2725012	2725017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_017857	AACG	2	8	2725030	2725037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6104	NC_017857	TCC	2	6	2725177	2725182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6105	NC_017857	T	6	6	2725190	2725195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_017857	TCAA	2	8	2725204	2725211	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6107	NC_017857	ATT	2	6	2725243	2725248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_017857	ACA	2	6	2725355	2725360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_017857	TTG	2	6	2725375	2725380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_017857	GCA	2	6	2725388	2725393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_017857	TGA	2	6	2726765	2726770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_017857	TCA	2	6	2727895	2727900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_017857	TAT	2	6	2727947	2727952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_017857	TAG	2	6	2727999	2728004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_017857	AAAG	2	8	2728316	2728323	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_017857	ATT	2	6	2728421	2728426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_017857	TA	5	10	2728491	2728500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_017857	AGAT	2	8	2728502	2728509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_017857	CTA	2	6	2728519	2728524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_017857	TTAT	2	8	2729406	2729413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_017857	TCA	2	6	2729438	2729443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_017857	ATC	2	6	2729510	2729515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_017857	TTTC	2	8	2729567	2729574	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6124	NC_017857	AT	3	6	2731216	2731221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_017857	T	7	7	2731274	2731280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_017857	ATG	2	6	2731297	2731302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_017857	ATT	2	6	2731310	2731315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_017857	ATA	2	6	2731335	2731340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_017857	TGATAT	2	12	2731365	2731376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_017857	A	6	6	2731418	2731423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6132	NC_017857	A	7	7	2731484	2731490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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